2008年两岸清明包机于4月2日至8日顺利实施，两岸11家航空公司在北京、上海、广州、厦门和台北、高雄6座城市间共执飞了21个往返航班，运送台湾同胞及其眷属5341人，平均载客率为73%。其中，大陆航空公司运送2228人；台湾航空公司运送3113人。

    今年是继2007年之后第二次实施两岸清明包机，参加的航空公司有大陆的国航、东航、上航、南航和厦门航空，以及台湾的华航、华信、长荣、立荣、复兴和远东航空公司。以上海航班最多，共计14个往返航班，是大陆航点中航班数量最多的一个。

    包机期间，大陆民航各有关公司和相关部门依然高度重视，认真对待，从飞行、地面保障和空防安全等各方面进行了精心准备，全方位予以保障。航空公司选派了经验丰富、技术过硬，具备飞台湾包机经验的飞行员、乘务员和机务人员以确保飞行安全和服务质量，并在各有关机场和空管单位的全力配合下，再次为台胞乘客提供了安全、准点、顺畅、优质的航空运输服务，圆满完成了此次两岸清明包机任务。

    据媒体报道，两岸清明包机自去年开始实施以来深受台胞的欢迎，省时省力，方便快捷，实实在在地帮助他们解决了往返两岸祭祖扫墓的问题。同时他们也对清明包机时间跨度太小表示了遗憾，强烈要求两岸周末包机能尽快成行。媒体舆论还呼吁，希望两岸包机进一步扩大航点、增加班次，扩大搭乘对象，切实满足两岸民众的实际需求。